Comparison of oncogenic HPV type-specific viral DNA load and E6/E7 mRNA detection in cervical samples: results from a multicenter study | J Med Virol. 2013


Authors: Francesco Broccolo, Lisa Fusetti, Sandra Rosini, Donatella Caraceni, Roberta Zappacosta, Lucia Ciccocioppo, Matteoli B, Philippe Halfon, Mauro S. Malnati, Luca Ceccherini-Nelli.
J Med Virol. 2013 Mar; 85(3): 472-82.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23280876


High-risk human papillomavirus (HR-HPV) genotype viral load and E6/E7 mRNA detection are proposed as surrogate markers of malignant cervical lesion progression. Currently, the use of commercially available DNA-based or mRNA-based tests is under investigation. In this study, the viral DNA load and E6/E7 mRNA detection of the five most common HR-HPV types detected in cervical cancer worldwide were compared in 308 cervical samples by using in-house type-specific quantitative real-time PCR assays and PreTect HPV-Proofer test, respectively. Sensitivity and negative predictive values were higher for the HPV-DNA assays combined (95.0% and 96.0%, respectively) than the RNA assays (77.0% and 88.0%, respectively); conversely, the mRNA test showed a higher specificity and higher positive predictive value (81.7% and 66.9%, respectively) than the DNA test (58.6% and 52.5%, respectively) for detecting histology-confirmed high-grade cervical intraepithelial neoplasia. A significantly higher association between viral DNA load and severity of disease was observed for HPV 16 and 31 (γ = 0.62 and γ = 0.40, respectively) than for the other HPV types screened. A good degree of association between the two assays was found for detection of HPV 16 (k = 0.83), HPV 18 (k = 0.72), HPV 33 (k = 0.66), and HPV 45 (k = 0.60) but not for HPV 31 (k = 0.24). Sequence analysis in L1 and E6-LCR regions of HPV 31 genotypes showed a high level of intra-type variation. HR-HPV viral DNA load was significantly higher in E6/E7 mRNA positive than negative samples (P < 0.001), except for HPV 31. These findings suggest that transcriptional and replicative activities can coexist within the same sample.

Dr. ssa Barbara Matteoli

Ho conseguito la Laurea Magistrale in Biologia, la Specializzazione in Microbiologia e Virologia, il Dottorato di Ricerca in Biotecnologie Mediche e il Master in Nutrizione Generale e Applicata alla Performance Motoria presso le Università di Pisa e di Siena. Già durante il percorso di studi e dopo, sono stata frequentatrice volontaria prima e Dirigente Biologo poi presso il l’UO di Virologia, Azienda Ospedaliera Universitaria Pisana, AOUP per la diagnosi molecolare e sierologica delle infezioni virali, isolamento virale da campioni biologici e la messa a punto e validazione di nuovi protocolli diagnostici; durante questo periodo ho acquisito piena padronanza delle tecniche di biologia molecolare. Già Professore a Contratto presso l’Università di Pisa, Facoltà di Biologia, per la docenza del corso: Scienze e Tecnologie biomolecolari e Cultore della Materia, settore Scientifico Disciplinare Med 07 Microbiologia e Microbiologia Clinica per il Corso di Laurea In Medicina e Chirurgia e Della Professioni Sanitarie, Università di Pisa, Facoltà di Medicina e Professore a contratto presso USL7 Siena, Alta Val d’Elsa Val di Chiana Senese, Amiata Val d’Orcia, Siena, per la Docenza del corso Percorsi di Analisi e Considerazioni Clinico-Diagnostiche, Nuovi Obiettivi.
Sono stata inoltre autore, editore e revisore per InTech - Open Access Company, il maggiore editore al mondo di libri in materia di scienza, tecnologia e medicina. Sono autrice di numerose pubblicazioni scientifiche.
Attualmente ricopro la posizione di Direttore di Laboratorio e Responsabile del Settore di Biologia Molecolare presso il Centro analisi LAMM. Mi sono specializzata nell’approccio molecolare alla nutrizione ed in particolare alle intolleranze e alla composizione del microbiota; collaboro con l’Associozione Italiana LattoIntolleranti (AILI).

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